牡丹区通过发展标准化无公害种植业，减少农业能耗，提高产品质量，增强市场竞争力。在农产品生产环节，大力推广节能增效技术，实施农业科技入户工程，把测土配方、精准施肥、增施农家肥、科学用药、生物防治病虫害等节能增效技术送到农民手中，严格控制无机肥和高毒、高残留农药的使用，减少生产资料消耗。目前，全区已完成测土配方施肥推广面积80多万亩，发展牡丹、芦笋、大蒜、甜瓜等标准化农产品生产基地90多万亩，其中无公害芦笋种植面积发展到3万余亩，被国家质检总局列为第六批国家级农业标准化示范区。

牡丹区既是农业大县又是畜牧大县，该区充分利用农作物秸秆资源丰富的优势，大力推广秸秆青贮氨化养畜技术，使大量农作物秸秆得到合理利用，减少焚烧秸秆对环境造成的影响。结合新农村建设大力发展沼气新能源，引导农民进行“改厨、改厕、改圈”，发展“猪、沼、菜(果)”等经济模式，全区已建设沼气池2万余座。积极引导规模养猪场采取生态发酵床饲养技术，推广环保养猪和林下养殖，促进了生态循环，减少了养殖成本，实现林牧资源的有效结合。目前，该区已建成生态环保养猪场20个，发展林下养殖面积16.5万亩，加快了养殖饲养业“零排放”的步伐。

大力发展植树造林，建设天然氧吧。牡丹区以生态林业区建设为契机，大力实施水系生态防护林带、绿色通道、农田林网、城镇村庄绿化、围村林改造等六大工程，大力实施林业产业战略。目前，全区现有林地面积41.2万亩，林木覆盖率达32.3%。预计到2015年，该区有林地面积加“四旁”折实面积将达到66万亩，林木蓄积量300万立方米，林木覆盖率35.2%，为加快发展低碳农业创造了良好的生态环境，使林业不仅成为农民的“绿色银行”，还成为社会的“天然氧吧”。